Рослина лілія є цибулинним багаторічником. Цибулини за розміром можуть бути крихітними – 1 см у діаметрі, а можуть бути більш ніж великими – до 30 см у діаметрі.
За формою вони кулясті або яйцеподібні, луски кріпляться на денце, де розташована точка росту коренів, на протилежному від денця боці луски не замикаються, тому цибулини лілій виглядають пухнато.
Стебло у лілій пряме, вкрите листям, вгорі галузиться слабо, залежно від виду і сорту від 15 до 250 см. В одних видів листя лілії завертається по спіралі на стеблі, а в інших – створює прикореневу розетку.
Квітки лілії зібрані в суцвіття циліндричної, конусоподібної або парасолькової форми по 8-16 квіток, але у деяких різновидів у суцвітті до 30 квіток, які розпускаються поступово від нижніх до верхніх. Живуть квітки від 3 до 9 днів.
Плоди лілій – довгі коробочки, що дозрівають до жовтня-листопада, в яких розташоване пласке насіння.